目前行政院衛生署－食品藥物管理局（TFDA）認定，牛樟芝生技產品屬第三類安全食品，在此分類之下主要進行六大毒理性試驗 :
(1)微生物基因突變分析顯示，對沙門氏桿菌不具致突變性。
(2)體外哺乳類細胞基因毒性分析顯示，對哺乳類細胞不具致基因突變性。
(3)動物活體基因毒性分析顯示，對動物造血機能不產生毒性，也不造成基因毒性。
(4)致畸胎試驗發現，沒有產生生殖與發育二期的毒性反應。
(5)大鼠急性毒性試驗發現，臨床觀察沒有副作用症狀產生，解剖觀察也未發現任何毒性病變。
(6)90天餵食毒性試驗顯示，臨床觀察未發現異常症狀，病理檢驗分析也無異常，組織病理檢查及臟器觀察也未發現任何毒性症狀。
牛樟芝子實體產品進行安全控管應先從菌種著手，牛樟芝是臺灣特有藥用真菌，透過DNA指紋比對及成分圖譜分析來對其進行身分鑑定，避免與其他菌種混用。接著是，牛樟芝的原生宿主，牛樟樹如何透過正常管道合法取得正確的牛樟樹段木亦為業者需把關之處。
有了好的菌種跟原料，廠商仍需要對生產過程進行把關，如何排除危害因子，將製程標準化，每批原料及成品進行指標成分規格含量檢定，以及相關的衛生檢驗，如重金屬、農藥、塑化劑、大腸桿菌等。此外，政府應支持訂定一套牛樟芝指標成分國家標準，方能讓「臺灣特有國寶級牛樟芝」不斷發光，成為代表臺灣保健產業之紅金產業。
